行政院南部聯合服務中心因千萬業務費遭立委院全數刪除，被迫大幅縮減開支，南服中心不得不實施多項撙節措施，嚴重衝擊便民服務品質。
南服中心執行長許乃文表示，此次業務費被刪減1036 萬多元，這筆預算原為中心日常運作的基本開銷。整棟大樓管理費一年約需 1 千萬元，南服中心負擔250 萬元，預算全刪造成很大財務缺口；因此，農曆年前中心便開始實施撙節措施，一切視狀況滾動式調整；中心先從內部節流，大幅縮減水電、郵資、油資等支出，辦公區域電燈間斷性關閉，停用一部電梯、關閉一樓大廳部分電燈、叫號系統和LED 資訊面板等。為降低對洽公民眾的影響，僅關閉合署辦公對外公共區域部分電燈，冷氣從24度調高至26度，不再於每間廁所提供衛生紙，並改為限量供應等。現階段只能雞蛋裡挑骨頭，嚴格控管開支，無奈之餘只能請大家共同配合節約。
執行長更提到，過去外交部南辦會到離島澎湖辦理「行動領務」業務，即外交部人員跨海到澎湖收件辦理護照，辦理完成後再郵寄給澎湖民眾，提供離島民眾便利的護照申辦服務，未來這項便民服務也可能因此停擺。
南服中心與外交部、移民署、勞保局、經濟部、智慧財產局、工業局、海基會等多個單位合署辦公，原設立目的是為便利南部民眾的洽公需要，並有17個部會代表進駐中心，負責地方與中央的協調工作，確保南部的業務推動、重大建設可以快速與各部會溝通，對南部地區的各項業務相當重要。
南服中心執行長一職屬政務官職位，應依學經歷與行政歷練任命，無論藍綠執政皆採政務任用。因此，不應僅以執政黨任命同黨人士為由，便全數刪除業務費，此舉更違背國民黨執政時設立服務中心的初衷。
許乃文執行長感慨，務實行政不應受政治影響，南服中心肩負政府與地方民眾溝通的重要職責，期盼各界避免政治操作影響行政運作，以確保民眾權益不受損害。同時，南服中心在有限資源下，仍會盡力提供民眾服務。