隨著居家隔離檢疫人數日增，行政院2日通過的「紓困振興特別條例」修正案，負責防疫工作的衛福部紓困預算為365億元，其中包含弱勢身障津貼每人每月1500元，預算40億元，防疫預算200億元，以及隔離檢疫補償加碼125億元。中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中2日表示，相關經費主要用於增購防疫物資、醫療機構紓困及津貼獎勵。
因新冠肺炎影響，衛生福利部提供民眾、醫療機構人員、醫療醫事機構、住宿式機構及藥商等紓困補償措施，首先在受隔離、檢疫者及照顧者，符合資格者在隔離及檢疫期間發給每日1千元補償金，根據衛福部統計，自3月23日先行開放受理受隔離或檢疫者防疫補償申請，截至109年3月30日上午8時止，已有1萬1676件提出申請。
至於照顧不能自理隔離檢疫者補償金，則自3月31日起開放受理申請，如果照顧者原本即無工作，包括退休、待業或家管等情形，就不符合照顧者防疫補償申請資格。此外，照顧者必須是二親等內的血親、姻親或者民法規定的家長、家屬。
無論是受隔離或檢疫者、照顧者防疫補償，皆可以線上、紙本郵寄或臨櫃等方式提出申請，衛福部則是呼籲民眾，可採線上申辦以節省排隊等候時間，其他還有醫療醫事機構、住宿式機構及藥商，其相關補助申請資訊，詳如以下網址：https://topics.mohw.gov.tw/COVID19/cp-4715-52167-205.html
如有防疫補償相關疑問，可於每日上午8時至下午10時撥打免付費的1957福利諮詢專線洽詢。