行政院為加強服務南部地區民眾、促進區域均衡發展及協調地方重要建設，由院長指示於高雄設置「行政院南部聯合服務中心」，並於八十七年六月一日開始運作。
本中心宗旨
- 1.提供有效率的單一窗口，服務南部地方民眾。
- 2.協調地方重大建設事項之推動，以促進南北均衡發展。
本中心定位
- 1.本中心定位以「服務」、「協調」為主，各事項涉及決策部份仍應循行政程序，由各主管機 關或提報行政院決定。
- 2.從組織架構而言，本中心係屬任務編組，由各單位依據其組織法令及業務法令行使職權，並以其機關名義對外行文，除本中心之協調聯繫及行政事務外，涉及單一中央主管機關權責者，仍由各該主管機關派駐單位循行政程序辦理。
本中心任務
依據行政院所訂頒之「行政院南部聯合服務中心設置要點」，本中心主要任務包括
（一）受理民眾各項證照申請及處理事項。
（二）提供民眾所需資訊、諮詢、服務及輔導事項。
（三）接受民眾對各部會主管事務之陳情及建議等事項。
（四）協調各部會及地方政府推動有關南部地區各項重大建設事項。
（五）協助各部會宣導相關政策、計畫及施政成果，並協調須地方配合辦理之事項。
（六）督導、協調及整合派駐南部地區之各部會機關，提升為民服務品質事項。
（七）推動南部地區資源整合，建立區域整合及溝通協調機制。
（八）提供兩岸交流事務服務及文書驗證等事項。
（九）其他涉及各部會主管權責須協調整合之事項。